São órgãos colegiados da CODERN:

– Conselho de Administração (ConsAd)
– Diretoria Executiva (DirEx)
– Conselho Fiscal (ConFis)
– Conselho de Autoridade Portuária (CAP)
– Assembleia
– Comitê de Auditoria (CoAud)
– Comitê de Elegibilidade