São órgãos colegiados da CODERN:
- Conselho de Administração (CONSAD)
- Diretoria Executiva (DIREXE)
- Conselho Fiscal (CONFIS)
- Conselho de Autoridade Portuária (CAP)
- Assembleia Geral
- Comitê de Auditoria (COAUD)
- Comitê de Elegibilidade
Comitês e Comissões
Comissão de Ética
Comitê de Juízo de Admissibilidade
Portaria DP 203- 2019 – Comitê de Gestão da Integridade (revoga portaria 064-18)
Comitê Gestor de Tecnologia da Informação
